基地大力發展特色生物制造產業，一是利用小麥、棉籽、紅棗、椹果等農產品，圍繞增強免疫功能、營養素補充、緩解體力疲勞、輔助降血脂等功能類型，開發營養補充劑、功能性保健品和功能性食品。二是開展玉米深加工，發展藥物糖和能源糖，拓寬生物糖醇原材料適用范圍，打造禹城市“中國功能糖城”名片。三是開展大豆深加工，生產高品質大豆食用蛋白、藥用蛋白、大豆素食食品、生物飼料等產品。四是發展工業酶制劑和新型食品防腐劑，加快乳酸鏈球菌素、納他霉素等新型食品防腐劑的研發生產，走新型生物防腐劑產業化之路。