關于完善疫苗管理工作機制，《意見》提出，一是健全國家免疫規(guī)劃疫苗調(diào)整機制，逐步推動將安全、有效、財政可負擔的第二類疫苗納入國家免疫規(guī)劃。二是完善預防接種異常反應補償機制，鼓勵建立通過商業(yè)保險等形式對預防接種異常反應受種者予以補償?shù)臋C制。三是建立疫苗流通和預防接種管理部際聯(lián)席會議制度，加強政策協(xié)調(diào)與銜接。

在促進疫苗自主研發(fā)和質(zhì)量提升方面，《意見》提出，支持新型疫苗尤其是多聯(lián)多價疫苗的研發(fā)和產(chǎn)業(yè)化，促進疫苗生產(chǎn)企業(yè)提高質(zhì)量管理水平和規(guī)范生產(chǎn)能力，提升疫苗產(chǎn)品質(zhì)量。

針對加強疫苗流通全過程管理，《意見》提出，一是規(guī)范疫苗集中采購工作，按照公開透明、競爭擇優(yōu)、公平交易的原則實行網(wǎng)上集中采購。二是加強疫苗冷鏈配送管理，建立健全疫苗冷鏈配送管理體系。三是加強疫苗生產(chǎn)、流通和使用全程追溯管理。四是加強疫苗監(jiān)管能力建設。

在規(guī)范預防接種管理上，《意見》提出，一是加強第二類疫苗接種統(tǒng)籌管理。二是加強接種單位規(guī)范化建設，規(guī)范接種單位設置、人員資質(zhì)、預防接種設施條件、冷鏈管理等。三是強化預防接種能力建設，加強醫(yī)療機構(gòu)預防保健科室建設，落實預防接種等公共衛(wèi)生職責。四是加強技術(shù)指導和考核評估。

為保障預防接種工作的順利開展，《意見》要求，一是保障疾病預防控制機構(gòu)人員編制。二是建立穩(wěn)定的疾病預防控制機構(gòu)投入機制，地方各級政府要足額安排疾病預防控制機構(gòu)基本建設、設備購置特別是冷鏈系統(tǒng)和信息化建設等發(fā)展建設支出，科學合理核定其人員經(jīng)費、公用經(jīng)費和業(yè)務經(jīng)費，足額列入預算。三是完善疾病預防控制機構(gòu)績效工資制度。四是完善預防接種相關價格政策，科學合理核定接種單位第二類疫苗接種服務費標準，盡快落實第二類疫苗儲存運輸費。五是加強預防接種宣傳。

《意見》強調(diào)，省級人民政府要落實屬地管理責任，加強組織領導，將預防接種等疾病預防控制工作情況、對疾病預防控制機構(gòu)財政政策落實等情況納入對下級人民政府考核內(nèi)容。